Cron Daemonから毎日送られてくるメールが来ないので、なんかへんだと思い調べらた、crondが起動してない事が分かりました。今まではyumでupdateを行ってもcrondが異常終了するようなことはありませんでしたが、今回の原因はpamのアップデートにより、/etc/pam.d/crondのauthとsufficientの間にTABが混入したため異常終了したようです。
Fedoraはyumでupdateした場合プロセスの再起動も行われるものと思ってたんですが、再起動しないものもあるようですね。今回はサーバーの再起動で解決しましたが、基本的にサーバーなんてのは24時間電源入れっぱなしで再起動なんてめったにしませんから、せっかくupdateされても古いバージョンが走ってたりしてるかもしれません。
ということは、定期的にサーバーの再起動を行わないといけないのかもしれませんね。